轮状病毒免核酸提取拉链式探针法环介导等温扩增体系的建立及应用

目的 自主研发一种快速简单的轮状病毒核酸检测免核酸提取试剂,再与探针法逆转录环介导等温扩增(Reverse 更多Transcription Loop-mediated isothermal amplification,RT-LAMP)体系相结合,建立一种快速、敏感、特异性高selleck VX-765的轮状病毒免核酸提取的探针法RT-LAMP检测方法,用于实时、快速的检测粪便中的轮状病毒(Rotavirus.RoV)。方法①通过正交试验组建3种免核酸试剂组分,分别提取血液标本中乙肝病毒DNA和尿液标本解脲支原体RNA,采用PCR方法检测核酸提取的效果,验证该免核酸提取试剂的敏感性、重复性、准确性。②设计轮状病毒的特异性LAMP引物及拉链式探针,利用正交设计对三对LAMP引物比例、探针比例、酶量、Mg2+浓度、模板量进行优化筛选,建立轮状病毒实时荧光探针法RT-LAMP体系,并对其特异性、灵prokaryotic endosymbionts敏度和重复性进行评价。③将上述的免核酸提取试剂与实时荧光探针法RT-LAMP体系相结合,建立免核酸提取探针法RT-LAMP方法检测轮状病毒,验证其重复性和特异性,并用临床标本比较普通PCR、免核酸提取探针法RT-LAMP检测方法阳性率的差异。结果①三种免核酸提取试剂仅有一种试剂能成功提取核酸,其最优pH为9,组分为:1.5%Tween20、0.5%Triton100、1.5%鼠李糖脂;核酸免提试剂与样本加样量比例为6:1,提取时间为10 min。②轮状病毒探针法RT-LAMP方法的检测下限为10 Copies/μL,未出现非特异性扩增,重复性实验的扩增曲线Ct值平均值变异系数均小于5%。③50例轮状病毒标本基于免核酸提取的探针法检测结果与普通PCR检测结果一致,灵敏度高于临床轮状病毒抗原检测方法。结论①本研究建立的免核酸提取方法可从尿液、血液、粪便等不同类型样本中提取RNA或DNA,且耗时短,提取率高,提取的核酸满足PCR、LAMP等分子生物学检测方法要求。②本研究建立的探针法RT-LAMP方法可以实时检测轮状病毒,且该方法具有简便快速、灵敏度高、特异性强、重复性好等特点。③本研究建立的基于免核酸提取的探针法RT-LAMP方法能作为一种快速、特异、灵敏、可靠的检测轮状病毒方法。